15.11.04

Ένας περίεργος απλότυπος στην Κρήτη

Η βάση yhrd επιτρέπει την εισαγωγή ενός απλοτύπου και τη σύγκρισή του με 26.654 διαφορετικούς απλοτύπους από όλο τον πλανήτη. Είναι ένα θαυμάσιο εργαλείο για την μελέτη της κατανομής διαφόρων μορφών χρωματοσωμάτων Υ ανά την υφήλιο.

Ένας απλότυπος είναι μια σειρά από νούμερα, π.χ 25-12-27-32, που δίνουν τον αριθμό επαναλήψεων σε συγκεκριμένους μικροδορυφόρους. Κάθε μικροδορυφόρος παρουσιάζει απανάληψη ενός μικρού τμήματος DNA, μήκους μερικών νουκλεοτιδίων, π.χ. CG. Οι επιστήμονες διαβάζουν τον γενετικό κώδικα κάθε μικροδορυφόρου, π.χ. CGCGCGCG και καταγράφουν τον αριθμό των επαναλήψεων, στη συγκεκριμένη περίπτωση 4.

Ένας απλότυπος αποτελείται από αρκετούς τέτοιους αριθμούς σε πολλούς διαφορετιούς μικροδορυφόρους. Εφόσον ο αριθμός αυτός μεταλλάσσεται -π.χ. το CGCGCGCG σε CGCGCG (από 4 σε 3) λόγω κάποιας διαγραφής- η ομοιότητα μεταξύ δύο απλότυπων χρησιμοποιείται για την εξακρίβωση του βαθμού συγγένειας μεταξύ δύο αντρών.

Δύο άντρες με ίδιο ή παρόμοιο απλότυπο έχουν πιθανότατα κοινό πρόγονο στο σχετικά πρόσφατο παρελθόν. Βέβαια, ο ίδιος απλότυπος δεν αποδεικνύει πάντοτε κοινό πρόγονο, αφού μπορεί να είναι αποτέλεσμα ομοπλασίας, δηλαδή το 25-12-27-32 μπορεί να προέρχεται μέσω μετάλλαξης από το 24-12-27-32 ή το 25-13-27-32, δηλαδή δύο διαφορετικούς άντρες. Όμως όταν έχουμε ομοιότητα σε μεγάλο τέτοιο αριθμό μικροδορυφόρων, η πιθανότητα ομοπλασίας γίνεται πολύ μικρή, και έτσι μπορούμε με αρκετή βεβαιότητα να πούμε πως δύο παρόμοιοι απλότυποι προέρχονται από κοινό πρόγονο.

Η βάση yhrd παρέχει στοιχεία για τη συχνότητα των διαφόρων απλοτύπων σε διάφορους πληθυσμούς, μεταξύ των οποίων και ένας πληθυσμός από την Κρήτη. Χρησιμοποιώντας τον πιο συχνό απλότυπο της Κρήτης (Population Analyses -> per population) μπορούμε να κάνουμε μιαν επερώτηση (Search database -> GeoSearch -> Haplotype), και να δούμε σε ποιες περιοχές εμφανίζεται αυτός. Τα αποτελέσματα φαίνονται στον παρακάτω χάρτη, ως κόκκινες κουκίδες.

Image Hosted by ImageShack.us

Όπως φαίνεται, ο συγκεκριμένος απλότυπος της Κρήτης είναι πολύ συχνός στην περιοχή της Βαλτικής, ενώ στην Ελλάδα παρουσιάζεται μόνο στη Χίο! Χρησιμοποιώντας τον εκτιμητή απλοομάδας, φαίνεται πως ανήκει πιθανότατα στην απλοομάδα R1a η οποία σχετίζεται με την Ανατολική Ευρώπη, τον πολιτισμό των τύμβων (kurgan) αλλά και με τους Σλάβους.
Δε μπορούμε να πούμε πότε έφτασε ο πρώτος άντρας με αυτόν τον απλότυπο στην Κρήτη.

Στα επόμενα χρόνια, ο χάρτης θα γεμίσει με ακόμα περισσότερες κουκίδες, καθώς περισσότεροι πληθυσμοί θα μελετηθούν. Η μέρα που κάποιος άντρας θα μπορεί με μιαν εξέταση DNA να γνωρίζει σε γενικές γραμμές την ιστορία των πατρικών του προγόνων -από δεκάδες χιλιάδες χρόνια στο παρελθόν έως και μερικές γενιές στο παρελθόν- δεν απέχει πολύ από την πραγματικότητα.

Βέβαια τα αποτελέσματα αυτής της γνώσης μπορεί να μην είναι πάντοτε τα αναμενόμενα. Αλλά σίγουρα, πρέπει να ετοιμαστούμε όλοι για την εποχή που η γενετική προϊστορία του καθενός μας θα παύσει να αποτελεί μυστήριο. Ακόμα και σήμερα, με ένα τεστ $130-200, και τη χρήση μιας βάσης όπως η yhrd, μπορούμε να πάρουμε μια γεύση του θαυμαστού καινούριο κόσμου της γενετικής επιστήμης.

7 σχόλια:

Ανώνυμος είπε...

Γειά σας,
Δείτε,
http://www.familytreedna.com/public/Greece/
http://www.familytreedna.com/surname_join.asp?code=D54498&special=True
Οι τιμές ξεκινούν απο $99 για τα μέλη της μελέτης......

Dienekes είπε...

Πόσοι markers συμπεριλαμβάνονται στην τιμή των $99;

Ανώνυμος είπε...

Psaxno yia tin aplomada pou eine sto xarti yia tin Peloponniso, alla fainete oti eine halazmeno to "link-population analyses". Otan to kano click, den fainete tipota.

Dean

Ανώνυμος είπε...

Exetaxa tin aplomada mou, I1b, me ta simadia sta Y DNA web sites, kai fainete opos eimai I1b. To I1b (P 37), opos kseraite, iparhi poli sta Balkanika, stin Croatia, Bosnia-Herzegovina, Slovakia, kai talipa. Koitaxa fotografies apo anthropous apo afta ta meri, kai den miasoume sto prosopo san pollous apo aftous. Paraxeno afto! O pateras mou itan xanthos, alla then emiaze toso poli me tous Kroatous kai Slovakous. Emiaze ligaki san ton Nikolaos Gatzoyiannis (Nicholas Gage) otan itane neos. Mipos eimaste blegmenous me Vlahous apo tin Romania i notia Balkanika, alla then miasoume, olo kai olo, san Slavous. Errotisa ton patera mou mia stigmi an nomise ama eimaste Slavoi, kai mou ipe oxi, oi Slavoi einai psiloi me mikra kefalia kai emeis eimaste mikroi me megala kefalia--oxi emena, eimai psiloteros kai melahrinoteros.

Dean

Dienekes είπε...

Ενδιαφέρουσα παρατήρηση για τα κεφάλια.

"The Serbs, for their stature, have, even more than the Slovenes, relatively small heads. The mean length is only 182 mm., the breadth 154.5 mm., while the auricular height mean is only 123 mm."

"they attain a national stature mean of about 168 cm."

http://www.fikas.no/~sprocket/snpa/chapter-XII12.htm

"The stature mean for Greeks in general runs about 167 cm., and there seems to be little regional variation;"

"Their heads, with a mean cephalic index of 82, are long for brachycephals (189 mm.), and of moderate breadth (154 mm.); the head height of 127 mm. is moderately high."

http://www.fikas.no/~sprocket/snpa/chapter-XII14.htm

Αυτά τα στοιχεία έχουν αλλάξει βέβαια από τότε (δεκαετία του 1930), αλλά πιθανώς οι σχετικές διαφορές να παραμένουν.

Με τον φυλετικό υπολογιστή (http://dienekes.angeltowns.net/calc/rac/) υπολογίζω εγκεφαλική χωρητικότητα 1,332 κυβ.εκ. για τους Σέρβους και 1,401 κυβ.εκ. για τους Έλληνες.

Αν διαιρέσουμε την χωρητικότητα με το ύψος, έχουμε

7.9 κυβ.εκ./εκ (Σέρβοι)
8.4 κυβ.εκ/εκ (Έλληνες)

Δηλαδή, πράγματι, οι Έλληνες έχουν μεγαλύτερα κεφάλια σχετικά με το ύψος τους και οι Σέρβοι έχουν μικρότερα κεφάλια.

Ανώνυμος είπε...

Pollous Slavous pou vlepo edo sto Chicago exoun mikra, stroggila kefalia/prosopa. Aftous tous taxinomizo efkola. Me aftous den miazoumai katholou. O pateras mou eixe poli megalo kranion(?)(cranium)kai itan makroprosopos. Itan karaflos, alla emiaze ligaki san ton arxaio Ellina filosofo Theofrastos--stin miti kai sto stoma.

H aplomada I1b ine, theorizoun, stin Adriatiki poli arxaio kai itan eki para polla xronia prin ilthan i Slavoglossoi, pou i istoria mas lei ilthan sti Adriatiki kata to 700 a.d. Apo ti ediavasa oi arxaioi Adriatikoi den emilagan Slavoika. Prin ilthan oi Slavoglossoi itan Latinized- or Latin-speaking Illyrians, due to Roman influence. Fainete oti pollous Adriatikous den itan proto-Slavoi, alla isos mirazan aplomada me tous proto-Slavous.

talos είπε...

Δεν είναι ανάγκη να πάει κανείς στην προϊστορία για να ανακαλύψει την προέλευση της "σλαβικής" συνιστώσας.

Μετά την επανακατάκτηση της Κρήτης από τον Φωκά, το μισο-ερημωμένο νησί, εποικίστηκε μαζικά από Ρώσους, (και Αρμένηδες και άλλους Βυζαντινούς). Ακόμα, σώζονται και τοπωνύμια που μαρτυρούν την προέλευση των αρχικών κατοίκων ("Αρμένοι", "Βουλγάρω" κτλ)